就在义军深耕发展，清廷意图变革的时候，位于南京的太平天国集团领导人之间的矛盾却越发明显。

太平天国的天王洪秀全为了制衡东王杨秀清和推动太平天国发展，从国外找回留学国外的胞弟洪仁玕，并封其为干王，主持改革事宜。

在洪仁玕的推动下，洪秀全下诏废除了基层太平军男女不得通婚、夫妻不得相见的律令，赢得了太平军上下的拥戴。

紧接着，洪仁玕立足于田亩，提出了人人有其田的口号，主持颁布了天朝田亩制度等法令，推动太平天国内部的土地改革制度。

然而，洪秀全和洪仁玕的变革，却引起了东王杨秀清的不满，他不仅屡次使用天父下凡的戏码公然责问甚至是羞辱两人，并且让手下直接阻挠干王的变法，两者之间矛盾越发激化。

在这个局面下，洪秀全不知是胆怯了还是处于其他目的，选择了退避，这也使得东王杨秀清越发肆无忌惮，常常因为一点小事就大发雷霆，对于太平天国各王都常常以天父的命令进行杖责。

这使得无论是洪秀全一脉还是北王韦昌辉、燕王秦日纲一党都对其十分不满。

在这种不利局面下，杨秀清不但没有丝毫的警醒，反而是越发肆无忌惮，彷佛他真的是上帝的化身了似的，他甚至不满于自己被称呼于九千岁，大张旗鼓的召集各王和各国使节开会，在会议上表演天父上身的戏码，对着跪下的天王责问道：

“杨秀清如此功高，为何你称万岁，而他却只称九千岁？”

在太平军教众和各国使节面前，洪秀全为了维护自己所谓上帝之子的法理性，只能捏着鼻子认了下来，没想到杨秀清在结束之后居然装模做样的询问洪秀全：“天父之前说了什么？”

此时洪秀全及其党羽就感觉被杨秀清喂了一坨狗屎还要让他描绘一下味道如何一样恶心，但迫于太平天国的宗教合法性，洪秀全也只能认了下去，下诏让百官见到杨秀清的时候皆是口称万岁。

这样一来，杨秀清越发飞扬跋扈，先后找了一些借口将北王韦昌辉、燕王秦日纲和干王洪仁玕等挨个打了一顿板子，彷佛这样就能树立他东王的威严来了。